电车不让上船主要是出于安全方面的考虑。具体原因如下：
- 电池自燃风险：电车的核心部件是动力电池，主要材料是锂。锂是活泼金属，与水或空气中的氧气接触会发生剧烈化学反应，产生大量热量和火花。电车动力电池容量和功率大，一旦发生故障或损坏，后果更严重。电池本身质量问题、过充过放、短路漏电、温度过高过低、机械损伤或外力冲击等因素，都可能导致电池内部化学反应失控，引发火灾。而且电池起火很难扑灭，用水浇会加剧反应，电池内部气体还会增加压力，造成爆炸危险。
- 海上运输环境特殊：海上轮船是密闭空间，装载大量人和车，发生火灾难以逃生，火势易蔓延，损失巨大。海上气候湿润且含盐，对电池材料和结构有腐蚀作用，降低电池稳定性和寿命。海上运输长途，电车在船上停放时间长，对电池耐久性和可靠性要求高，出现故障或异常的风险增加。
为了保障航运安全，一些港口对电车运输进行严格管理，如海南规定每艘船上搭载的新能源汽车不能超过车辆总数的10%，且上限为18辆，新能源车辆还需停放在船上指定区域。大连到烟台的轮渡则直接禁止了新能源车乘船。