长春有轨电车的付费方式因线路类型有所不同，以54路有轨电车文旅专列和普通运营线路为例，具体如下：
- 54路有轨电车文旅专列：采用线上预约的购票方式，通过微信小程序搜索“54路文化专列”实现购票、选座。具体步骤为进入小程序后，先在“我的-领券中心”领取20元代金券，再在首页选择日票或夜票，然后选择日期、时间段、票档，进入选座页面选座并确认，支付成功即完成购票。日票88元，夜票118元，均包含门票1张、饮品+甜品+文创纪念品各1份。
- 普通运营线路：可使用长春轨道交通官方APP“长春E出行”扫码乘车。乘客可通过苹果和安卓手机应用商店下载并注册该APP，体验“免零钱，免带卡，先乘车，后付费”的扫码乘车方式。此外，由于长春轨道交通全线支持支付宝扫码乘车，理论上有轨电车普通线路也可能支持支付宝扫码。乘客打开支付宝首页点击“出行”，按提示录入所需信息领取“长春轨道交通电子乘车卡”，乘车时将二维码对准闸机扫一扫即可入闸乘车，出站时再扫一次二维码扣取车费。
另外，长春轨道交通售票设备支持支付宝、微信扫码支付，在有轨电车普通线路的相关售票设备上，也可能可以通过手机支付宝、微信扫码支付来购票和充值。