电车自燃保险公司是否赔偿，视具体情况而定，主要分析如下：
投保相关险种情况
- 投保车损险及自燃险
- 车辆自身故障自燃：如果电车因自身质量问题，如电池缺陷、电路故障等引发自燃，车损险可以赔偿车辆自身的损失；若还投保了自燃险，也可按自燃险条款进行赔付。
- 其他意外因素自燃：如因外界的意外因素，如雷击等导致电车自燃，车损险也在赔偿范围内；自燃险同样对非车辆质量问题导致的自燃提供保障。
- 只投保车损险未投保自燃险
- 新能源车：根据《新能源汽车商业保险专属条款（试行）》，新能源车无论是在行驶、停放还是充电过程中发生的自燃，已明确纳入车损险的理赔范围。
- 非新能源车：一般的传统电车车损险条款可能对自燃保障存在限制，如果自燃仅造成电器、电路等部分损失，保险公司可能不赔。
- 未投保车损险和自燃险：若车主没有投保车损险及自燃险，保险公司通常不会对电车自燃造成的车辆自身损失进行赔偿。但如果自燃造成了第三者的车辆损伤、人员损伤或财产损失，且车主投保了第三者责任险，那么对于这部分损失，保险公司会根据责任认定情况在三者险的限额内进行赔偿。
责任免除情况
- 非法改装：车主自行对车辆进行非法改装或安装电器，改变了车辆原有电路等系统，导致车辆自燃，保险公司一般会拒绝赔偿。
- 未按规定年检：车辆未按期进行年检，处于不符合安全行驶标准的状态下发生自燃，保险公司有权拒赔。
- 放置危险物品：因在车内放置危险物品，如易燃易爆物品等，导致车辆自燃，保险公司可能不予赔偿。
- 违反操作规程：车主或他人违反车辆安全操作规程，如在禁止充电的环境充电等导致自燃，保险公司通常不赔付。