学校保安锁电车是否违法需要视具体情况而定：
- 违法的情况
- 无违规停放等正当理由：如果学生或其他人员的电动车停放等行为没有违反任何规定或妨碍他人及公共秩序等，学校保安擅自锁车，属于侵犯车主财产权益的行为，是违法的。比如在学校没有相关规定且车辆停放合规的情况下，保安无故锁车。
- 超越授权范围：即使学校有相关管理规定，但保安超出了学校赋予的权限范围锁车，也可能构成违法。例如学校规定只能对特定区域的违规车辆锁车，保安却对其他区域的合规车辆进行了锁止。
- 可能不违法的情况
- 有合法规定和授权：学校有合理合法的规章制度，且经过相关部门备案或符合法律要求，明确规定了电动车的停放、使用等规则，对于违反规定的车辆，保安在得到学校明确授权的情况下锁车，是为了维护校园秩序和公共安全等正当目的，一般不违法。如学校依据消防法规等制定规定，禁止在消防通道停放电动车，保安对停在消防通道的电动车锁车。
- 行使自助行为且符合规定：如果电动车的存在确实给学校的正常管理或公共安全等造成了紧迫的危险或妨碍，在无法及时找到车主等紧急情况下，保安为避免危险或妨碍扩大，依据自助行为的相关规定进行锁车，且及时通知了车主或采取了合理后续措施，也可能不违法。